53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2287 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  958    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  25.95 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  27.62 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.2 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  36.07 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  23.22 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  25.13 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  22.79 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  33.33 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  34.81 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  29.32 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.34 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  35.04 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  32.06 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  31.06 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  26.29 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  67  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  30.83 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  27.74 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  38.64 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  28.89 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.6 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  27.39 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  25.94 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  21.56 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  32.61 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  24.68 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  22.59 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.83 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  25.65 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  27.01 
 
 		 617 aa  57  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  38.46 
 
 		 227 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  32.89 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  26.92 
 
 		 355 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  34.48 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  29.36 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  31.34 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  30.59 
 
 		 339 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  30.77 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  28.75 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.47 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  23.29 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  28.75 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  29.13 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  32.32 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.89 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.4 
 
 		 647 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  43.18 
 
 		 603 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  36.73 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>