77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0764 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  39.59 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  42.26 
 
 		 369 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  41.22 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  37.86 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  35.79 
 
 		 391 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  32.9 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  33.85 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  34.3 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  43.3 
 
 		 224 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  40.22 
 
 		 227 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  26.67 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.33 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  38.14 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  38.14 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  37.61 
 
 		 478 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  37.61 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  30.84 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  39.17 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  31.93 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  33.62 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  35.59 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  46.75 
 
 		 96 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  32.81 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  32.81 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  28.93 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  30.83 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  28.37 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.67 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  25.42 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.73 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  38.36 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.82 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  26.76 
 
 		 595 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.68 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  24.05 
 
 		 483 aa  53.5  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  21.85 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  21.86 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  23.22 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  22.95 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.97 
 
 		 669 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  31.33 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  36.56 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.31 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.31 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  32.38 
 
 		 457 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  24.63 
 
 		 508 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  39.68 
 
 		 359 aa  46.2  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  50 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  39.13 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  23.58 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  30.48 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  42.19 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.41 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  36.56 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  39.02 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  39.77 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  37.33 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  26.15 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  32.29 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  26.67 
 
 		 446 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  30.88 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  28.23 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  44.44 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 615 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  29.36 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  22.51 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  44.83 
 
 		 533 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>