51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl296 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  927    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  29.89 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  29.96 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.97 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  26.92 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.92 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.92 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  28.08 
 
 		 565 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  28.12 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  23.18 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  28.46 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  25.69 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  29.01 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  25.31 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  27.5 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  24.1 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  28.12 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  27.41 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  28.22 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  22.65 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  25.42 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.71 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  28.68 
 
 		 224 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  24.05 
 
 		 371 aa  53.5  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  27.33 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  27.97 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  23.97 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  25.12 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  21.61 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  29.91 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 548 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  34.15 
 
 		 378 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  50 
 
 		 591 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.37 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  30.4 
 
 		 696 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  23.53 
 
 		 227 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  36 
 
 		 641 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.81 
 
 		 728 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.25 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.24 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  19.54 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  32.26 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  34 
 
 		 619 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>