27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2713 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  814    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  28.02 
 
 
429 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  28.08 
 
 
433 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  30.18 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  29.07 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2799  hypothetical protein  32.23 
 
 
143 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3300  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  22.53 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  22.53 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  35.37 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.85 
 
 
652 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  37.63 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
495 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  24.84 
 
 
461 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  32.93 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  53.85 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0291  hypothetical protein  22.14 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.06 
 
 
579 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.44 
 
 
614 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.48 
 
 
513 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.89 
 
 
586 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  21.93 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  34 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  30.11 
 
 
483 aa  43.5  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  32.67 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  23.74 
 
 
641 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>