57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1535 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  918    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  38.1 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.9 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  22.54 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  27.03 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  26.27 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  24.89 
 
 		 408 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  24.16 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.25 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  27.08 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  25.1 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  24.94 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.61 
 
 		 527 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  36.02 
 
 		 617 aa  96.7  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  25.95 
 
 		 467 aa  96.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.87 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  32.62 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  29.55 
 
 		 514 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  38.89 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  38.81 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.96 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  31.52 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.03 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  32.26 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  27.61 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  33.58 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  26.87 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  29.49 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  31.15 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  29.94 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  28.93 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  33.6 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  29.75 
 
 		 227 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  36.26 
 
 		 255 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  40 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.93 
 
 		 548 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.35 
 
 		 628 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.44 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  29.49 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  46 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  23.3 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  31.52 
 
 		 307 aa  46.6  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1348 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  28.1 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.95 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  23.6 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.77 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.72 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  33.33 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  38.36 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1181 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  26.28 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  34.92 
 
 		 457 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  50 
 
 		 650 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>