28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4715 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  49.72 
 
 		 555 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  34.34 
 
 		 595 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  36.26 
 
 		 457 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  36.26 
 
 		 565 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.03 
 
 		 527 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  53.49 
 
 		 647 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 645 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  50.94 
 
 		 877 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  44.44 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  43.75 
 
 		 1223 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  47.73 
 
 		 790 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  55.81 
 
 		 628 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.5 
 
 		 603 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  31.87 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  48.94 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  22.08 
 
 		 460 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  30.17 
 
 		 465 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.51 
 
 		 616 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.65 
 
 		 681 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  39.02 
 
 		 394 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.16 
 
 		 605 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  43.48 
 
 		 429 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.16 
 
 		 607 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  49.02 
 
 		 686 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.62 
 
 		 708 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  44.9 
 
 		 580 aa  42  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  24.46 
 
 		 465 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>