54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0707 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  29.38 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  28.31 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  28.35 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.4 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  27.41 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  27.36 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.18 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  30.57 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  28.46 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  24.57 
 
 		 408 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  28.29 
 
 		 224 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  28.76 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  26.01 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  31.29 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  27.91 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.29 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  26.99 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  29.49 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  34.07 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  33.6 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  24.46 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  28.48 
 
 		 595 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.46 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  31.96 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  27.15 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  30.37 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  26.43 
 
 		 555 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  32.89 
 
 		 467 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  24.67 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  25.61 
 
 		 513 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  45.28 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  26.62 
 
 		 617 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  45.83 
 
 		 419 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  37.5 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  36.36 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.15 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.15 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  27.45 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  32.56 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  27.45 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  38.78 
 
 		 529 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  32.22 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  45.45 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.23 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  40.91 
 
 		 604 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.79 
 
 		 461 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  39.58 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>