72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3739 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  876    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  69.65 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  57.99 
 
 		 408 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  34.1 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  34.57 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  34.33 
 
 		 464 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  34.13 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.6 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.86 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  24.94 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.59 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  31.62 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  28.71 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  31.42 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  26.94 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  27.36 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  22.27 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  25.81 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  29.33 
 
 		 617 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  26.62 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  24.15 
 
 		 508 aa  87  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  33.88 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  33.06 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  33.13 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  28.76 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  31.34 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  32.35 
 
 		 224 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  28.81 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  32.26 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  27.27 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  32.52 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  25.87 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  29.56 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  31.69 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  24.1 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.83 
 
 		 548 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.15 
 
 		 642 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 572 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  29.27 
 
 		 688 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  32.43 
 
 		 583 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  29.51 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  26.17 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  32.62 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  30.19 
 
 		 566 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  23.78 
 
 		 513 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  32.73 
 
 		 1167 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.87 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  21.81 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.17 
 
 		 677 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.17 
 
 		 677 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  40.74 
 
 		 597 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  25.53 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  27.55 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  24.29 
 
 		 429 aa  46.6  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  38.81 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  34.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  38.46 
 
 		 890 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  48 
 
 		 96 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  37.97 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  39.13 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  32.18 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  33.8 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  22.7 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  35.29 
 
 		 496 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  28.42 
 
 		 584 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30.69 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  25.9 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  19.55 
 
 		 666 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>