74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3220 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  873    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  69.65 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  54.93 
 
 		 408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  33.61 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  31.89 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  34.05 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  41.95 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  28.77 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.87 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  26.73 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  26.9 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  31.65 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.06 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  26.18 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  30.08 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  29.01 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  27.29 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  25.44 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  31.12 
 
 		 617 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  35.15 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  31.5 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  29.71 
 
 		 510 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  36.29 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  35.54 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  28.24 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  34.65 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  30.59 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  31.71 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  28.09 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  22.79 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  31.45 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  35.59 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.58 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  27.52 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  31.71 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  22.65 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.69 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.37 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  22.79 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  34.33 
 
 		 513 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.28 
 
 		 680 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.49 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 666 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.42 
 
 		 548 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.25 
 
 		 566 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  31.82 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.31 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  22.58 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.43 
 
 		 688 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.23 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  26.02 
 
 		 597 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  27.55 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  26.72 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.81 
 
 		 584 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  33.98 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  25.76 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  33.98 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.36 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  33.8 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  34.52 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  30.77 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  26.81 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  21.78 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  34.15 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  26.81 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  47.83 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 		 1146 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  27.97 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  27.14 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  37.84 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  26.32 
 
 		 572 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  26.98 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  36.54 
 
 		 586 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>