50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2733 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  970    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  38.85 
 
 
465 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  37.73 
 
 
466 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  34.1 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.07 
 
 
408 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  41.95 
 
 
429 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  29.33 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.41 
 
 
459 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  27.37 
 
 
478 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  26.74 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  34.03 
 
 
527 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  27.03 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  30.62 
 
 
617 aa  99.8  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  40.65 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  31.36 
 
 
369 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.45 
 
 
510 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  30.43 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  28.82 
 
 
514 aa  86.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  28.52 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  28.88 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.52 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  26.71 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  39.17 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  24.66 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  27.51 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  26.3 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  34.68 
 
 
224 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  26.56 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  34.87 
 
 
595 aa  76.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  26.73 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  31.29 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  27.89 
 
 
227 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  23.18 
 
 
483 aa  63.9  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  21.56 
 
 
467 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  22.9 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  47.83 
 
 
496 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  27.42 
 
 
451 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  21.36 
 
 
572 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  34.21 
 
 
597 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  26.62 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 
349 aa  47  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0051  hypothetical protein  35.21 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118613  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  31.87 
 
 
96 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  32.84 
 
 
513 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.83 
 
 
688 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  27.27 
 
 
476 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  31.08 
 
 
140 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  32.58 
 
 
486 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>