45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0828 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  70.97 
 
 		 466 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  964    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  40.43 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  38.85 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.89 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  34.13 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.41 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.11 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  25.98 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  24.95 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  22.54 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  26.37 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  30.8 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  23.3 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  31.66 
 
 		 451 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  28.34 
 
 		 514 aa  96.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  30.73 
 
 		 617 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  40.6 
 
 		 565 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.74 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  21.48 
 
 		 508 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  29.41 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  27.24 
 
 		 435 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  27.88 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  33.85 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  24.68 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.51 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  35.67 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  26.52 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  31.62 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  29.2 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  25.6 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  27.74 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  32.81 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  29.5 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.73 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.67 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  21.17 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  29.9 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  30.08 
 
 		 361 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  30.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  21.22 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>