65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01780 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  43.78 
 
 
374 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  36.25 
 
 
378 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  34.54 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  33.85 
 
 
371 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  33.6 
 
 
369 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  32.1 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  31.27 
 
 
391 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  30.1 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  36.62 
 
 
224 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.36 
 
 
374 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.73 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  34.65 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  31.34 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  34.96 
 
 
459 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.89 
 
 
527 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  32.81 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  32.24 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  40 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  24.66 
 
 
465 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  39.17 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  31.62 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  32.35 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  34.19 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  29.49 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  34.81 
 
 
514 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.61 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  28.47 
 
 
555 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  40.62 
 
 
461 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  29.05 
 
 
565 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  28.89 
 
 
467 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  27.59 
 
 
595 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  27.27 
 
 
508 aa  59.7  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  46.97 
 
 
457 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  24.53 
 
 
510 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  41.94 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  34.15 
 
 
483 aa  50.8  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  28.57 
 
 
617 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  23.27 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  32.29 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  20 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.71 
 
 
647 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  21.9 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.64 
 
 
623 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  36.49 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  45.45 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  25.56 
 
 
250 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  28.83 
 
 
564 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0895  hypothetical protein  30.53 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.295883  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  35.9 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  27.27 
 
 
446 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  35.06 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1615  hypothetical protein  33.68 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.273235  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  32.95 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  34.78 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  29.03 
 
 
441 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  28.57 
 
 
572 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  37.31 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  34.67 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  26.85 
 
 
416 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  36.62 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  29.63 
 
 
390 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>