70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1460 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  802    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  44.64 
 
 
377 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  35.79 
 
 
371 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  35.43 
 
 
368 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.2 
 
 
378 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  34.44 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  34.26 
 
 
363 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  31.27 
 
 
378 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.42 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  37.74 
 
 
224 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  28.35 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  34.64 
 
 
227 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.46 
 
 
459 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  26.68 
 
 
459 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.51 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.39 
 
 
527 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  38.33 
 
 
478 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  33.61 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  32.26 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  23.39 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  27.51 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.45 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  31.15 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  28.3 
 
 
555 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  31.06 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  22.6 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.86 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  29.5 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  41.76 
 
 
96 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.81 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  26.47 
 
 
464 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  26.24 
 
 
508 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  26.35 
 
 
510 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  22.13 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.34 
 
 
460 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.34 
 
 
460 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  21.4 
 
 
583 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  44.68 
 
 
513 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  34.88 
 
 
595 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.91 
 
 
483 aa  50.4  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  38.24 
 
 
461 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.63 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  32.22 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.85 
 
 
708 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  22.71 
 
 
387 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  36.99 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  26.81 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  38.78 
 
 
581 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  43.18 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  42 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  38.6 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  31.51 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  29.51 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  36.54 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.04 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  36.73 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  35.29 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  48.08 
 
 
669 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  32.47 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25 
 
 
564 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  39.34 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.73 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  34.25 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  26.61 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.61 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  23.81 
 
 
617 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  36.76 
 
 
565 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  34 
 
 
281 aa  43.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>