68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0136 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  66.07 
 
 
369 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  51.29 
 
 
378 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  59.32 
 
 
227 aa  224  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  41.96 
 
 
363 aa  198  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  43.3 
 
 
371 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  36.67 
 
 
377 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  39.07 
 
 
374 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  37.74 
 
 
391 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  38.91 
 
 
368 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  36.62 
 
 
378 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  45.08 
 
 
459 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  42.86 
 
 
459 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  42.86 
 
 
478 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  30.48 
 
 
435 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  40.34 
 
 
451 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  35.5 
 
 
378 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  28.29 
 
 
374 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  32.35 
 
 
428 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  28.57 
 
 
527 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  33.85 
 
 
465 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  33.59 
 
 
466 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  34.68 
 
 
465 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  34.81 
 
 
467 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  30.3 
 
 
457 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  30.58 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  31.54 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  28.97 
 
 
514 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.86 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  27.74 
 
 
508 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.85 
 
 
461 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  34.03 
 
 
555 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  26.9 
 
 
510 aa  61.6  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  29.29 
 
 
595 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  31.34 
 
 
565 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  33.64 
 
 
513 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.68 
 
 
483 aa  53.5  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  27.43 
 
 
617 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  38.36 
 
 
556 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  28.36 
 
 
457 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  35 
 
 
388 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.91 
 
 
460 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  41.51 
 
 
533 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  30.56 
 
 
441 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.91 
 
 
460 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  33.72 
 
 
486 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  28 
 
 
390 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.4 
 
 
597 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  35.92 
 
 
546 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.93 
 
 
451 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  31.07 
 
 
385 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  30.88 
 
 
565 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.91 
 
 
669 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  26.36 
 
 
392 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  35 
 
 
437 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  32.47 
 
 
549 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.52 
 
 
385 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  29.87 
 
 
394 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  24.67 
 
 
376 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  27.62 
 
 
442 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  25.66 
 
 
395 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.72 
 
 
390 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  24.05 
 
 
634 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  28.38 
 
 
564 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 
615 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.72 
 
 
659 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  28.12 
 
 
431 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.24 
 
 
393 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>