36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0116 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1246    Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  30.62 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.12 
 
 		 429 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  36.02 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  30.73 
 
 		 465 aa  94.4  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  29.41 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  30.56 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  29.33 
 
 		 428 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  33.17 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  29.09 
 
 		 466 aa  88.6  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  28.93 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  32.95 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  42.2 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  32.37 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  30.96 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.21 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.02 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.86 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  27.57 
 
 		 595 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  30.77 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  24.14 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  33.63 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  27.01 
 
 		 467 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  24.1 
 
 		 461 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  44.23 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  26.67 
 
 		 369 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.57 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  27.43 
 
 		 224 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  50.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  26.55 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.44 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  26.62 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.79 
 
 		 584 aa  47.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.97 
 
 		 615 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>