31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1538 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  930    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  42.47 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  30.31 
 
 
456 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  25.1 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  25.1 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  23.41 
 
 
513 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  22.24 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  23.08 
 
 
396 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  42.31 
 
 
527 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  22.92 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  22.98 
 
 
533 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.4 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.4 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  23.67 
 
 
556 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.48 
 
 
510 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  32.35 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  41.94 
 
 
508 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  25.74 
 
 
459 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  23.97 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  40 
 
 
623 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  21.99 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  32.56 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  36.51 
 
 
564 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  35.87 
 
 
446 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  27.45 
 
 
419 aa  43.9  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  25 
 
 
428 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.98 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  41.38 
 
 
353 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  45.24 
 
 
307 aa  43.5  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  23.36 
 
 
308 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  43.4 
 
 
352 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>