46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0789 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  793    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  40.56 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  39.52 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  22.84 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  21.21 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  23.31 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  32.58 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  40.68 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  48.89 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  24.84 
 
 		 277 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  28.97 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  36.11 
 
 		 586 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  38.46 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  34.07 
 
 		 533 aa  46.2  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.71 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.33 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  45.45 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  34.18 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  34.62 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  24.64 
 
 		 796 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.83 
 
 		 616 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  29.89 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  47.06 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  22.22 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  31.48 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  52.5 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  46.55 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.86 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  31.48 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  29.36 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  48.98 
 
 		 587 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  28.4 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  36.14 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  30.49 
 
 		 311 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  30 
 
 		 664 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  46.94 
 
 		 587 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2486  excinuclease ABC subunit A  31.97 
 
 		 926 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  32.22 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  32.22 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  42.59 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  31.63 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  37.78 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>