61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0211 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  100 
 
 		 586 aa  1196    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  34.59 
 
 		 602 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  32.53 
 
 		 597 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  26.49 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  23.63 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  22.96 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  28.37 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  30.47 
 
 		 518 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  22.87 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  31.94 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  31.72 
 
 		 556 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  27.32 
 
 		 558 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  22.51 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  30.87 
 
 		 564 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  32.99 
 
 		 567 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  38.75 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  32.18 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.96 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  27.39 
 
 		 654 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  21.41 
 
 		 368 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  64.71 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.34 
 
 		 442 aa  47.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  36.11 
 
 		 396 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.94 
 
 		 584 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  39.71 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.17 
 
 		 540 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  26.46 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 382 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  37.5 
 
 		 505 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  28.97 
 
 		 408 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  30.4 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  39.19 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  33.68 
 
 		 630 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  55.56 
 
 		 1141 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.43 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  31.51 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  44.68 
 
 		 1177 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  38.67 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  28.99 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1176 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  29.06 
 
 		 602 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  29.41 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  46.15 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1176 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  40.91 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  32.23 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  38.46 
 
 		 623 aa  44.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.39 
 
 		 652 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  32.47 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  29.21 
 
 		 572 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  40.74 
 
 		 323 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  32.93 
 
 		 566 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  39.71 
 
 		 448 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  34.41 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  30.52 
 
 		 249 aa  44.3  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  32.88 
 
 		 650 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 583 aa  43.9  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  34.83 
 
 		 595 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>