16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0989 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  889    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  38.17 
 
 
429 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  28.85 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  27.08 
 
 
437 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  28.08 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  35.88 
 
 
461 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  29.95 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  26.39 
 
 
513 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  29.17 
 
 
532 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  25.41 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.33 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.88 
 
 
608 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  31.48 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  31.03 
 
 
666 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.82 
 
 
457 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>