45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4117 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  881    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  38.94 
 
 
437 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  29.69 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  28.85 
 
 
433 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  31.45 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  25.67 
 
 
461 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  25.19 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  27.17 
 
 
513 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  34.52 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.62 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 
574 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.62 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  35.53 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.57 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  30.11 
 
 
595 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.69 
 
 
623 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.51 
 
 
597 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.56 
 
 
224 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.83 
 
 
603 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  31.46 
 
 
497 aa  46.6  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  27.91 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  31.34 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.25 
 
 
377 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  24.59 
 
 
588 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  38.46 
 
 
666 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  21.53 
 
 
680 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  33.33 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.5 
 
 
615 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  28.21 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.86 
 
 
496 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.14 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.68 
 
 
642 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  32.94 
 
 
495 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  32.17 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.03 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  27.42 
 
 
374 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.5 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  27.19 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  36.23 
 
 
540 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  27.78 
 
 
691 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  27.96 
 
 
606 aa  43.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.4 
 
 
661 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>