33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3360 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  893    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  38.94 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  29.87 
 
 
429 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  29.07 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  30.61 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  30.16 
 
 
513 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.93 
 
 
461 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  26.74 
 
 
533 aa  49.7  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 
548 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.17 
 
 
224 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  20.73 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  33.33 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  28.85 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  36.23 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  25 
 
 
556 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  26.47 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  26.51 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  24.87 
 
 
460 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  31.73 
 
 
228 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  24.87 
 
 
460 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.46 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  41.67 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  50 
 
 
607 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  24.24 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  31.08 
 
 
227 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
495 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  26.92 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  41.38 
 
 
594 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  41.67 
 
 
623 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.67 
 
 
594 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>