16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3383 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  941    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  29.79 
 
 
461 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  29.58 
 
 
476 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  35.33 
 
 
461 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  31.2 
 
 
457 aa  87  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  23.11 
 
 
513 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  28.92 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  28.92 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  33.82 
 
 
451 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  38.24 
 
 
459 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  38.24 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  23.52 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  25.64 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  25.76 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.02 
 
 
584 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  30.88 
 
 
459 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>