40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1132 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  718    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  24.16 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  39.39 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  24.04 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.34 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  21.82 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  34.33 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  50 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  45.65 
 
 		 378 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2488  hypothetical protein  61.54 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.11421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  22.34 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  52.5 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  20.93 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  50 
 
 		 564 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  39.68 
 
 		 533 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  47.73 
 
 		 565 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  55 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  25.83 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  21.64 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  50 
 
 		 604 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  45.65 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  51.02 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  36.36 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  47.83 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  50 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  45.65 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  36.73 
 
 		 634 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  48.65 
 
 		 647 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  46.67 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  36.96 
 
 		 565 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  47.83 
 
 		 650 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  38.98 
 
 		 453 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  40.35 
 
 		 460 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  43.9 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  50 
 
 		 619 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  45.45 
 
 		 579 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  30.69 
 
 		 427 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  33.72 
 
 		 1063 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>