More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0249 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  47.06 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  47.86 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  48.75 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  45.83 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  48.12 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  48.5 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  47.7 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  44.17 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  43.23 
 
 		 269 aa  204  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  46.15 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  48.31 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.02 
 
 		 322 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.16 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  44.16 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  40 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  42.73 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 		 276 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  43.67 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  42.31 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  39.18 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  43.35 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  41.03 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  47.23 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  43.83 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.21 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  42.92 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  42.53 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  45.06 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  37.18 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.46 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  38.03 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.92 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.86 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  40.71 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  40.74 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  36.55 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  38.89 
 
 		 444 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  44.05 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.71 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  37.86 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.44 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  38.94 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  38.37 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.34 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  36.36 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  41.63 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  34.53 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  41.28 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  40.27 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  34.66 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.94 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  37.39 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  37.45 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.3 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  40.26 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.78 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.76 
 
 		 268 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  39.35 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.29 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  31.76 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.05 
 
 		 414 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  31.49 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.22 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  34.82 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  35.5 
 
 		 412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  34.48 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  35.71 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.22 
 
 		 418 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  33.48 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  34.82 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  34.82 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.22 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  34.82 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  34.41 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  31.54 
 
 		 424 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  35.29 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>