More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1595 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  57.25 
 
 
256 aa  315  7e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
269 aa  292  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  51.53 
 
 
277 aa  289  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  49.22 
 
 
277 aa  278  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 
256 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  48.24 
 
 
257 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  48.24 
 
 
257 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  47.45 
 
 
256 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  41.76 
 
 
262 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  42.19 
 
 
259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  41.57 
 
 
259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  46.5 
 
 
260 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  45.21 
 
 
265 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  45.1 
 
 
268 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  47.08 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.96 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  43.02 
 
 
278 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  44.4 
 
 
264 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
257 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
269 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  41.41 
 
 
266 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  40.33 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.63 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  40 
 
 
260 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  42.35 
 
 
263 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.35 
 
 
263 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  44.26 
 
 
274 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  45.74 
 
 
261 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  40.78 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  43.88 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  40.5 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  41.2 
 
 
272 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  39.26 
 
 
278 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  40.23 
 
 
253 aa  192  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
276 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  38.93 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
252 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
259 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  42.36 
 
 
261 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.45 
 
 
253 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  36.61 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
252 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.52 
 
 
258 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  38.64 
 
 
279 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  32.96 
 
 
276 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  38.41 
 
 
268 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 
245 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  42.5 
 
 
254 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  36.99 
 
 
258 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.51 
 
 
253 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  37.92 
 
 
261 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  41.42 
 
 
262 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
259 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  33.57 
 
 
280 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 
261 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  40.08 
 
 
257 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  36.6 
 
 
259 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.87 
 
 
444 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.33 
 
 
418 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.55 
 
 
269 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.82 
 
 
424 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  39.26 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  39 
 
 
262 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  35.43 
 
 
264 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  39.08 
 
 
252 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  39 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  40.53 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.16 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  36.1 
 
 
256 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.7 
 
 
266 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
266 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 
269 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.8 
 
 
250 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  35.97 
 
 
266 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.59 
 
 
266 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  36.08 
 
 
253 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
254 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 
262 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.11 
 
 
264 aa  159  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  35.69 
 
 
260 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  35.29 
 
 
253 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  35.2 
 
 
269 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
256 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  38.39 
 
 
245 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  35.77 
 
 
259 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
265 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
283 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.13 
 
 
255 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  37.86 
 
 
252 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
264 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  34.25 
 
 
268 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  34.16 
 
 
252 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  36.86 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>