More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1513 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  47.46 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  46.58 
 
 
278 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.15 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  49.15 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
261 aa  198  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  48.4 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  43.7 
 
 
262 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  49.78 
 
 
261 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  44.92 
 
 
264 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
242 aa  192  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.55 
 
 
322 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  42.91 
 
 
279 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  43.89 
 
 
272 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 
269 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  46.81 
 
 
256 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
256 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.51 
 
 
253 aa  185  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  43.87 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  48.87 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  45.57 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  42.27 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  43.39 
 
 
257 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  47.49 
 
 
256 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  43.16 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
259 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
260 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  40.43 
 
 
280 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  44.68 
 
 
257 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  44.68 
 
 
257 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  41.55 
 
 
266 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.84 
 
 
260 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
245 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  39.24 
 
 
258 aa  175  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  42.13 
 
 
260 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
290 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  39.08 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  37.18 
 
 
268 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  50.22 
 
 
245 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.17 
 
 
257 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  36.44 
 
 
259 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.61 
 
 
277 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
257 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  41.39 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
256 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  43.33 
 
 
261 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
257 aa  165  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  44.26 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  36.12 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.6 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.66 
 
 
258 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 
269 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  37.34 
 
 
256 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  40.27 
 
 
261 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
266 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  44.07 
 
 
259 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 
268 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
258 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  38.75 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.34 
 
 
424 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  40.51 
 
 
255 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
255 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  37.34 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 
253 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 
255 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  38.89 
 
 
290 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1712  ABC transporter related  38.59 
 
 
261 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  38.02 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.5 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  39.66 
 
 
414 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  40.51 
 
 
248 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.49 
 
 
419 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  39.32 
 
 
266 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
536 aa  151  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
490 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.5 
 
 
253 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.59 
 
 
262 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2312  ABC transporter related  41.95 
 
 
271 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
252 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
261 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.17 
 
 
264 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  36.44 
 
 
261 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
262 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.89 
 
 
258 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  39.42 
 
 
262 aa  149  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
257 aa  148  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.97 
 
 
256 aa  148  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  38.89 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.46 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.68 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.74 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.83 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.41 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>