More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3844 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  99.61 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  91.44 
 
 		 256 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  75.29 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  71.15 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  54.65 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  51.36 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  47.08 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  53.08 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  58.92 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  48.24 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  48.06 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  45.82 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  44.09 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  49.03 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  50.6 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  49.21 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  46.51 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  54.09 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  43.21 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.54 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  47.83 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  47.64 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.64 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.96 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  43.85 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  46.85 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  41.91 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  45.85 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  41.76 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  48.41 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  46.06 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  39.38 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  42.75 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  49.16 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  44.86 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  41.25 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  47.06 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  45.45 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  38.27 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  38.49 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.13 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.74 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  44.21 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.51 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  41.5 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.74 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  47.58 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.66 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.23 
 
 		 424 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.58 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.93 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.65 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.24 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.45 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.66 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  39.27 
 
 		 444 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  39.09 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  43.59 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.37 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.06 
 
 		 409 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  47.68 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  42.91 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  40.49 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  39.76 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.66 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.86 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.69 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.31 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  43.04 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.81 
 
 		 418 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  42.28 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>