More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1214 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  543  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  76.81 
 
 
274 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  48.64 
 
 
258 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  49.79 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  45.68 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  46.47 
 
 
262 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  44.53 
 
 
275 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  44.71 
 
 
255 aa  235  6e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  45.31 
 
 
268 aa  235  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  49.79 
 
 
274 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
262 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  45.35 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  50.21 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  39.29 
 
 
252 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  44.3 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  40.55 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  38.89 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  38.89 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  38.49 
 
 
260 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  42.58 
 
 
260 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
257 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  41.15 
 
 
252 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  45.96 
 
 
254 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 
262 aa  205  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 
250 aa  205  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  43.36 
 
 
250 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 
276 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  40 
 
 
418 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  44.76 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  44.35 
 
 
275 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  43.78 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  40.15 
 
 
409 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  43.56 
 
 
252 aa  194  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
268 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
278 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  43.27 
 
 
283 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.11 
 
 
253 aa  191  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
274 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
275 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  42.44 
 
 
256 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  40.85 
 
 
299 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  42.45 
 
 
269 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  43.55 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  43.55 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  42.68 
 
 
282 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  39.29 
 
 
254 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
272 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  43.15 
 
 
262 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  37.96 
 
 
266 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
273 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
266 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.53 
 
 
262 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  41.39 
 
 
258 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  40 
 
 
273 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  185  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  40 
 
 
273 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.92 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4898  ABC transporter-like  41.6 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  0.0112209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  41.87 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  34.78 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.86 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  40.82 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
256 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.78 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.67 
 
 
625 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  37.55 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.73 
 
 
257 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  41.6 
 
 
278 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
272 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  45 
 
 
260 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  36.15 
 
 
259 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
418 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
263 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  40.73 
 
 
303 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.34 
 
 
269 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
536 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
249 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  41.77 
 
 
286 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.89 
 
 
260 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.63 
 
 
384 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  44.05 
 
 
267 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
272 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  38.24 
 
 
272 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  39.11 
 
 
269 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>