More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1378 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  832    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 
418 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  40.39 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  40.26 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.29 
 
 
455 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.59 
 
 
405 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  36.91 
 
 
421 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  50.41 
 
 
264 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 
419 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  36.76 
 
 
427 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  36.17 
 
 
417 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  36.65 
 
 
421 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  37.54 
 
 
421 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  35.68 
 
 
427 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
266 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
536 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
490 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  46.55 
 
 
262 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.81 
 
 
424 aa  230  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
268 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  46.48 
 
 
267 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  43.65 
 
 
266 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  35.43 
 
 
419 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
262 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  45.61 
 
 
268 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.91 
 
 
268 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  42.86 
 
 
266 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  44.08 
 
 
264 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  41.18 
 
 
264 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.51 
 
 
269 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  33.82 
 
 
414 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  43.65 
 
 
275 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  43.65 
 
 
275 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  42.35 
 
 
296 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  33.87 
 
 
412 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.49 
 
 
274 aa  209  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  42.49 
 
 
274 aa  209  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  40.86 
 
 
271 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
296 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.84 
 
 
253 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  33.25 
 
 
416 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.25 
 
 
260 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
282 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
255 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
264 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  39.36 
 
 
255 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
256 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
265 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  40.44 
 
 
283 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  40.44 
 
 
283 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  40.86 
 
 
280 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  39.84 
 
 
264 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.08 
 
 
302 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  202  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2424  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
302 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  32.44 
 
 
375 aa  202  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.15 
 
 
260 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.11 
 
 
625 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  39.45 
 
 
307 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  40.82 
 
 
258 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.55 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.49 
 
 
257 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  40.71 
 
 
275 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  40.32 
 
 
271 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
253 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
277 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
266 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.96 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.96 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  38.52 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.55 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.87 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  44.34 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
263 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  38.49 
 
 
265 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
266 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  40.32 
 
 
273 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.87 
 
 
290 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
278 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  43.46 
 
 
258 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  39.36 
 
 
267 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 
255 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.04 
 
 
262 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  39.41 
 
 
258 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  39.68 
 
 
265 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  39.68 
 
 
265 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  39.36 
 
 
261 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  40.15 
 
 
274 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>