More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3202 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  100 
 
 
405 aa  824    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  41.78 
 
 
416 aa  305  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.9 
 
 
418 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.59 
 
 
409 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  36.73 
 
 
424 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  35.28 
 
 
418 aa  260  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
490 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.59 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  33.5 
 
 
419 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  33.68 
 
 
414 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  33.17 
 
 
455 aa  236  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
266 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  35.11 
 
 
421 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  32.95 
 
 
424 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  33.33 
 
 
427 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  32.93 
 
 
421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  34.55 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 
419 aa  213  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  33.87 
 
 
421 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  32.27 
 
 
427 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 
268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  40.49 
 
 
266 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.65 
 
 
264 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 
255 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.06 
 
 
266 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  41.05 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 
253 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
251 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  39.34 
 
 
255 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  37.1 
 
 
270 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 
271 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  38.43 
 
 
251 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  38.56 
 
 
257 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.2 
 
 
269 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 
258 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  36.14 
 
 
264 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  35.98 
 
 
267 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
262 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  37.65 
 
 
253 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  37.13 
 
 
266 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  38.02 
 
 
260 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  40.17 
 
 
271 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  35.56 
 
 
260 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  37.18 
 
 
271 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  36.71 
 
 
271 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  39.31 
 
 
273 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 
261 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  37.13 
 
 
259 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  39.92 
 
 
275 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  35.83 
 
 
260 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  37.9 
 
 
255 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
272 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  31.07 
 
 
375 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
264 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.53 
 
 
262 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
258 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  35.56 
 
 
260 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
278 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.92 
 
 
274 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.92 
 
 
274 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  38.74 
 
 
257 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.52 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  32.23 
 
 
258 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.25 
 
 
254 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  36.76 
 
 
261 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  36.76 
 
 
261 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  37.2 
 
 
261 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
262 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
265 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.22 
 
 
268 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  31.25 
 
 
412 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  35.5 
 
 
259 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.51 
 
 
266 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
290 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
259 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  36.29 
 
 
271 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.2 
 
 
256 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.59 
 
 
255 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
255 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.59 
 
 
255 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.59 
 
 
255 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
259 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  38.06 
 
 
264 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  35.83 
 
 
260 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  36.36 
 
 
260 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
262 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  35.8 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  37.71 
 
 
264 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
255 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  34.44 
 
 
274 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  38.96 
 
 
262 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 
260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  36.22 
 
 
278 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  35.93 
 
 
275 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 
265 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 
265 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>