More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1212 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  51.78 
 
 
258 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
266 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
490 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  40.74 
 
 
266 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  42.5 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  40.74 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
536 aa  191  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  39.5 
 
 
455 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.65 
 
 
405 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.71 
 
 
258 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.82 
 
 
414 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0562  ABC transporter related  38.24 
 
 
264 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.2 
 
 
424 aa  178  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  36.29 
 
 
266 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.72 
 
 
419 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  38.08 
 
 
293 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  40.33 
 
 
279 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  36.63 
 
 
271 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  40.08 
 
 
284 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  39.41 
 
 
262 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  41.53 
 
 
264 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  39.33 
 
 
254 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  38.59 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  35.92 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  35.92 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  35.37 
 
 
303 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  41.33 
 
 
418 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.46 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  34.58 
 
 
255 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
275 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.55 
 
 
424 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
275 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  35.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  38.15 
 
 
268 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  37.5 
 
 
258 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  35.74 
 
 
271 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  40.33 
 
 
273 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  35.37 
 
 
258 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  40.6 
 
 
269 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  39.55 
 
 
275 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
279 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
274 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
251 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.87 
 
 
257 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
276 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.49 
 
 
253 aa  168  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
259 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  36.82 
 
 
278 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.73 
 
 
255 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  37.97 
 
 
275 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  34.03 
 
 
260 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.44 
 
 
254 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.55 
 
 
275 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.72 
 
 
260 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.59 
 
 
268 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  35.63 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  35.34 
 
 
271 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.61 
 
 
280 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  34.12 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
250 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  36.48 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  35.04 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  39.73 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  36.16 
 
 
274 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  36.86 
 
 
253 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  35.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  33.61 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  35.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.19 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  37.66 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  37.4 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  41.35 
 
 
259 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
290 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 
262 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  35.63 
 
 
261 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  35.63 
 
 
261 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  37.45 
 
 
274 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  35.63 
 
 
261 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 
270 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  35.78 
 
 
265 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>