More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0631 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  87.69 
 
 		 260 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  85.1 
 
 		 259 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  74.32 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  68.48 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  67.31 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  63.81 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  55.25 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  52.17 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  52.44 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  51.63 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  46.34 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  45.82 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.97 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  48.22 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  51.38 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  41.84 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.56 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  50.59 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.45 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.61 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.55 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  45.75 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  35.92 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  47.7 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  42.79 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 536 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  40.71 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 266 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  43.15 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.25 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.39 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  43.25 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.2 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.76 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.76 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  37.87 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  45.31 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.82 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  41.49 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  36.82 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  41.84 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.29 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  42.86 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  39.41 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  42.55 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  49.33 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  42.13 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  47.35 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.49 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  44.16 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.67 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  36.29 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.98 
 
 		 625 aa  158  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  37.13 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.65 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.29 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  39.11 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.66 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.82 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.68 
 
 		 414 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  43.64 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  41.99 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  37.8 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.75 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.48 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  33.6 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>