More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2923 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  66.54 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  57.2 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  55.04 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  56.2 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  55.25 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  57.09 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  56.35 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  43.82 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  47.68 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.52 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  45.28 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  42.29 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  46.19 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.04 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  44.8 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.72 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.75 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  41.39 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.86 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.16 
 
 		 414 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  44.36 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  36.9 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  38.19 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 536 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  45.49 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  44.73 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.05 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.45 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.37 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  41.28 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.33 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  40.08 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  44.4 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.6 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39.66 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  43.1 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  37.39 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.01 
 
 		 409 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  38.71 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.17 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.71 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  37.55 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  32.1 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  37.39 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  37.83 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  36.75 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  36.75 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  37.71 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  42.55 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.32 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  38.29 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  30.21 
 
 		 405 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  41.86 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.24 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  43.04 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  33.49 
 
 		 416 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.49 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.36 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.6 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.27 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  31.64 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  42 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.69 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.11 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  38.43 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 424 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  38.96 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  40.08 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>