More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2362 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  84.71 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  75.2 
 
 		 254 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  68.22 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  67.83 
 
 		 260 aa  341  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  72.66 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  66.54 
 
 		 267 aa  311  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  63.92 
 
 		 266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  51.29 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  41.91 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  42.54 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  43.75 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.65 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  37.44 
 
 		 242 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  42.92 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.65 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 490 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  40 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  40.64 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  44.59 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  44.16 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 536 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.42 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.7 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  42.13 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  42.66 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.9 
 
 		 625 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  40.25 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.16 
 
 		 424 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.46 
 
 		 414 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.64 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  41.7 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  39.53 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  44.44 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  39.22 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.86 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.43 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.43 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  35.32 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  42.01 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  43.21 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  40.35 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.5 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  37.85 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  39.42 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.33 
 
 		 290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  39.92 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.6 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.49 
 
 		 405 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  41.35 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  41.35 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  40.51 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.61 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  37.15 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36.89 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36.89 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.25 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  37.9 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  32.68 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  42.27 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  36.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.35 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.99 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.14 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  31.6 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  40.93 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  31.6 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  32.54 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  38.96 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.25 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  37.6 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.48 
 
 		 273 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.76 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>