More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  100 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  55.42 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  52.34 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6327  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  54.96 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  54.07 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 301 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  41.02 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  41.02 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.59 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  38.33 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.59 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.2 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  48.42 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  45.9 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40.32 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.4 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.33 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.33 
 
 		 455 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  44.35 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  39.92 
 
 		 427 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4513  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.57 
 
 		 418 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.29 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1079  ATPase  40.66 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  40.68 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  37.4 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  42.32 
 
 		 427 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  40.96 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.52 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.4 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  40.57 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.2 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  40.71 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  37.5 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.4 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.02 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  37.97 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.5 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  41.22 
 
 		 278 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.91 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  39.02 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  41.55 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.96 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.96 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  36.89 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  38.55 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.67 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.67 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  44.26 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  37.55 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.6 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  41.49 
 
 		 421 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  38.61 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.07 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  40.8 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  38.31 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  41.53 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.94 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.77 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  40.23 
 
 		 282 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 		 419 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.4 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 490 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  33.46 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  43.27 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  37.4 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  37.4 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>