More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3279 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  96.56 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  91.22 
 
 		 262 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  86.64 
 
 		 262 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  70 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  70.24 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  58.68 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  57.63 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  52.99 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  54.73 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  52.99 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  51.88 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  49.37 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  46.78 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  50.63 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  43.43 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  47.26 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  48.4 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  48.95 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46.44 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  43.98 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.2 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  45.3 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.45 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.6 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  45.25 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  47.27 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  47.27 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  47.27 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  39.76 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  44.09 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.96 
 
 		 339 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  45.27 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.03 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  40.94 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.32 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.67 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.67 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.6 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.24 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.11 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  43.09 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.7 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.71 
 
 		 409 aa  175  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  42.53 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  38.11 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.11 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  47.95 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  41.06 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.48 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.25 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.38 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  39.91 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.95 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  43.84 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.87 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.86 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  41.67 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.7 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.08 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.34 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.36 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.95 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.57 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.57 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  43.35 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  38.1 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  45.31 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.34 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.16 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.66 
 
 		 418 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36.75 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3577  ABC transporter related  44.63 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  41.47 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>