More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5561 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 259 aa  530  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  93.44 
 
 		 259 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  64.98 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  61.09 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  57.81 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  57.81 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  57.81 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.53 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  52.14 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  48.31 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  47.45 
 
 		 297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  47.45 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  47.45 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  47.45 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  47.43 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  45.14 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  45.14 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  50.22 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  45.14 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.31 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  45.31 
 
 		 321 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  46.41 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  48.54 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  42.41 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  42.41 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  40.08 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  47.23 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  39.69 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.41 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.53 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  52.04 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.55 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  47.66 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  41.41 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.83 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  41.8 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  43.81 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  46.03 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.64 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  44.83 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.75 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  40.08 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 536 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  46.58 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  39.68 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.1 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  46.89 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.73 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.02 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.62 
 
 		 409 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  45.21 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  45.85 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  45.5 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  44.44 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  40 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 490 aa  181  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.08 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.3 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  40 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  33.59 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.09 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1310  ABC transporter related  34.16 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  41.53 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  42.51 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39.04 
 
 		 419 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  36.44 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.41 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  36.44 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.5 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.84 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.59 
 
 		 490 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  36.29 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40 
 
 		 339 aa  171  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.59 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>