More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0404 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
264 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  46.43 
 
 
280 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
295 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 
263 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
263 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 
265 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
265 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 
265 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 
265 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
265 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  45.38 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  45.38 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  45.38 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  44.8 
 
 
258 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  45.8 
 
 
260 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  43.8 
 
 
262 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  43.28 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  43.82 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  40.21 
 
 
384 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  40.65 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.69 
 
 
259 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  39.3 
 
 
259 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  43.48 
 
 
307 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  45.11 
 
 
255 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  38.58 
 
 
270 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  46.06 
 
 
257 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.46 
 
 
267 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  41.27 
 
 
321 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  41.27 
 
 
321 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.96 
 
 
262 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  44.92 
 
 
285 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.43 
 
 
257 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  41.18 
 
 
326 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  42.86 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  42.86 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  42.86 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.24 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  42.86 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
262 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  42.44 
 
 
297 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.5 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  40.23 
 
 
324 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  42.39 
 
 
274 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  41.84 
 
 
269 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  43.27 
 
 
274 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  42.44 
 
 
253 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
490 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  45.5 
 
 
274 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.6 
 
 
418 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.44 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  47.75 
 
 
263 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.02 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  45.13 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  39.17 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  41.49 
 
 
254 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  43.62 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  40.7 
 
 
266 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.39 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
264 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
265 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  38 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.61 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  40 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  41.49 
 
 
264 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  47.95 
 
 
262 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  39.92 
 
 
257 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45 
 
 
285 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.2 
 
 
264 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
265 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  39.42 
 
 
254 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  43.6 
 
 
256 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.14 
 
 
414 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
263 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
536 aa  175  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  45.83 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  37.45 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  47.95 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.73 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.67 
 
 
419 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.33 
 
 
409 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  37.08 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.01 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.83 
 
 
424 aa  171  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  37.12 
 
 
375 aa  171  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
261 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.17 
 
 
251 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.17 
 
 
268 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.08 
 
 
339 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 
251 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  38.4 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 
418 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.75 
 
 
268 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  40.55 
 
 
266 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 
261 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>