More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26400 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  96.11 
 
 
257 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  69.84 
 
 
280 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  65.13 
 
 
262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.53 
 
 
259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  59.92 
 
 
259 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  63.45 
 
 
261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  63.45 
 
 
261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  63.45 
 
 
261 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
295 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
265 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  55.46 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  49.21 
 
 
297 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  49.4 
 
 
297 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  49.21 
 
 
297 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  49.21 
 
 
297 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.4 
 
 
285 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  49.2 
 
 
279 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  48.02 
 
 
321 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  48.21 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  48.81 
 
 
293 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  47.62 
 
 
326 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  51.9 
 
 
261 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  49.41 
 
 
307 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  51.18 
 
 
285 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  46.4 
 
 
308 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 
311 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.37 
 
 
271 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 
324 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  47.2 
 
 
258 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  49.79 
 
 
255 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  47.93 
 
 
384 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  49.57 
 
 
262 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
275 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  42.4 
 
 
259 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  45.63 
 
 
254 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  45.24 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  57.65 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  43.43 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  46.03 
 
 
253 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  40.78 
 
 
270 aa  208  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
262 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  50 
 
 
265 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
251 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.44 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  46.81 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  48.02 
 
 
257 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  47.88 
 
 
257 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  48.43 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  47.26 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.94 
 
 
251 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  42.37 
 
 
253 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
261 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  42.02 
 
 
276 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.51 
 
 
285 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  46.99 
 
 
253 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  44.67 
 
 
414 aa  188  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.44 
 
 
273 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  49.18 
 
 
263 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.37 
 
 
264 aa  184  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.36 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  45.15 
 
 
424 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  45.96 
 
 
254 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
262 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.63 
 
 
266 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  40.68 
 
 
424 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  46.9 
 
 
264 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.32 
 
 
536 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
264 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.97 
 
 
339 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.32 
 
 
269 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  50 
 
 
315 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
256 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  34.92 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  37.4 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.27 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.92 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  38.72 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  39.09 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.74 
 
 
409 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  33.2 
 
 
259 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
265 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
265 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40 
 
 
268 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.32 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
265 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>