More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2164 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  47.47 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  46.95 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  46.95 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  45.98 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.62 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  47.67 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  46.06 
 
 		 307 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  45.9 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  45.63 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  45.63 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  45.63 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  45.63 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.83 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  44.7 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  41.25 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  41.6 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  41.6 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  42.52 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  40.23 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  41.67 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.8 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.41 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  38.58 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  40.07 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  42.55 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 263 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.29 
 
 		 418 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  40.8 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  38.43 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  39.34 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  36.61 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.68 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.78 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.78 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  39.42 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.76 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  33.73 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.61 
 
 		 409 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  40.65 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.41 
 
 		 455 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  39.48 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  39.23 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.18 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  33.99 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.65 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  37.01 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  37.85 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  36.33 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  37.1 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  36.19 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  35.57 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.54 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.29 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  37.31 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  37.02 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  36.02 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  36.51 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  35.52 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>