More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2166 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  100 
 
 
253 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  69.57 
 
 
270 aa  353  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  61.6 
 
 
272 aa  299  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  43.8 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  51.59 
 
 
292 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  50.39 
 
 
255 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  47.43 
 
 
271 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  46.8 
 
 
266 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  46.8 
 
 
266 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  46.8 
 
 
266 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  46.18 
 
 
261 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  48.62 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.29 
 
 
409 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  46.64 
 
 
271 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
266 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  43.65 
 
 
269 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.64 
 
 
262 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  46.48 
 
 
255 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  49.22 
 
 
255 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  49.22 
 
 
255 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  43.24 
 
 
269 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.18 
 
 
266 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  43.65 
 
 
264 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  45.42 
 
 
253 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.97 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  46.88 
 
 
255 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  46.09 
 
 
255 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.34 
 
 
307 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.13 
 
 
268 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  40.38 
 
 
262 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  44.36 
 
 
260 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  44 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 
260 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 
284 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  46.09 
 
 
262 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  45.31 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.52 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  48.83 
 
 
255 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.57 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  43.14 
 
 
490 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  41.25 
 
 
293 aa  181  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.85 
 
 
424 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  45.28 
 
 
267 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  37.84 
 
 
269 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  48.44 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.49 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  45.1 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  41.54 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  37.85 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  36.22 
 
 
254 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
264 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  43.97 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.83 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
275 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.44 
 
 
257 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.71 
 
 
455 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
261 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  38.21 
 
 
270 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
265 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  46.46 
 
 
277 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  46.67 
 
 
257 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  39.2 
 
 
321 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.76 
 
 
418 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.2 
 
 
253 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.92 
 
 
285 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  32.02 
 
 
258 aa  176  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  40.55 
 
 
444 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  43.63 
 
 
259 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  46.64 
 
 
256 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
268 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  44.71 
 
 
269 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  42.37 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.08 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  39.11 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  42.74 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  40.16 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.8 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  41.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  41.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.8 
 
 
326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  38.52 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.37 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  42.47 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.74 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.17 
 
 
405 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.65 
 
 
268 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>