More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1301 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  48.96 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  43.37 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  48.09 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  44.58 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.45 
 
 		 339 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  40.64 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.13 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  42.23 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  44 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  45.49 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  40.8 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  44.54 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  40.8 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.22 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  43.37 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  40.8 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  43.04 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.23 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.56 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.24 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  39.76 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  39.76 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  39.76 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  39.76 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  40.51 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  39.84 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  43.28 
 
 		 285 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.38 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.25 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.17 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  44.92 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  38.96 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  37.7 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  42.92 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  39.13 
 
 		 455 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  41.37 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 536 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  38.96 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  40.51 
 
 		 405 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.32 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.36 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  42.68 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  42.68 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  40 
 
 		 418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  46.64 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  40.35 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.97 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  40.17 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.41 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  44.74 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.57 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  39.58 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  37.75 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 		 418 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  43.32 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  39.53 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  44.17 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  39.22 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3105  ATPase  44.62 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 254 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  44.89 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  41.08 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  41.98 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  45.1 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.45 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  45.1 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  40.85 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  40.93 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  42.86 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.59 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>