More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0971 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  69.02 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  69.02 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  69.02 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  68.63 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  69.02 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  57.25 
 
 		 255 aa  324  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  59.36 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  59.13 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  56.18 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  57.14 
 
 		 263 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  50.4 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  52.16 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  51.19 
 
 		 269 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  51.19 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  51.38 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  48.61 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  51.37 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 277 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.21 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4777  ABC transporter related  53.01 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0195446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  50.4 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50.4 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  52.67 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  47.24 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  48.21 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  45.85 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.22 
 
 		 302 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  47.04 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  48.22 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  48.61 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  47.62 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  47.24 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.42 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  46.25 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  48.81 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  48.81 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  47.06 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  49.21 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  49.41 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  46.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  47.22 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  46.83 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  47.22 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  46.67 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  46.67 
 
 		 273 aa  244  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.11 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  48.41 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  47.22 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  47.62 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  47.62 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  49.2 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  43.82 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  47.62 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  44.98 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  44.98 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  45.24 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  47.22 
 
 		 280 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  48.24 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  46.43 
 
 		 273 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.02 
 
 		 290 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.41 
 
 		 625 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  46.06 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  48.02 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>