More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2242 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  96.11 
 
 
257 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  69.05 
 
 
280 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  63.22 
 
 
262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.53 
 
 
259 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  59.92 
 
 
259 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
265 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  63.05 
 
 
261 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  63.05 
 
 
261 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  63.05 
 
 
261 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
263 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.06 
 
 
265 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.06 
 
 
263 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.06 
 
 
295 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
265 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
265 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
265 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  54.2 
 
 
260 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  46.83 
 
 
321 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  46.83 
 
 
321 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  47.22 
 
 
297 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  47.22 
 
 
297 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.41 
 
 
285 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  47.22 
 
 
297 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  47.22 
 
 
297 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  47.62 
 
 
269 aa  248  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  48 
 
 
279 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  51.97 
 
 
285 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  46.43 
 
 
326 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  51.05 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  46.43 
 
 
293 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  47.04 
 
 
307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 
311 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  50.62 
 
 
255 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  44.4 
 
 
308 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.7 
 
 
271 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 
324 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  47.52 
 
 
384 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  45.6 
 
 
258 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  42 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  48.26 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  41.34 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  45.24 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  43.03 
 
 
283 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  44.84 
 
 
254 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  57.14 
 
 
274 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  46.03 
 
 
253 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
265 aa  201  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
262 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  46.38 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  48.03 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.94 
 
 
251 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  47.62 
 
 
257 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.11 
 
 
253 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
261 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  47.03 
 
 
257 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.96 
 
 
285 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  41.95 
 
 
253 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  41.6 
 
 
276 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  45.08 
 
 
414 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  45.57 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  46.99 
 
 
253 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  43.22 
 
 
264 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  45.99 
 
 
424 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  49.18 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  46.81 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.36 
 
 
257 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.22 
 
 
273 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.21 
 
 
266 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.15 
 
 
269 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
536 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.85 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  46.46 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.16 
 
 
339 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
256 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
264 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  48.47 
 
 
262 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
265 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  43.22 
 
 
249 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
265 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  37.87 
 
 
264 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.74 
 
 
409 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  39.83 
 
 
424 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
265 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
265 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
270 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  40.43 
 
 
265 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
265 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
265 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  37.15 
 
 
270 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
270 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>