More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2599 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  91.73 
 
 
254 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  59.36 
 
 
254 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  55.95 
 
 
253 aa  298  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  55.56 
 
 
253 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  57.6 
 
 
257 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  55.56 
 
 
253 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
264 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  53.97 
 
 
257 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  51.39 
 
 
254 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  53.33 
 
 
268 aa  244  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  50.6 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
275 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  49.4 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  48.21 
 
 
255 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  47.15 
 
 
261 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  51.32 
 
 
263 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  46.77 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  46.77 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  46.37 
 
 
261 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  54.43 
 
 
315 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 
285 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  43.82 
 
 
279 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  43.08 
 
 
326 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  45.59 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  52.97 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  51.95 
 
 
254 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  49.58 
 
 
285 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.33 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 
260 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  43.65 
 
 
321 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  50.88 
 
 
263 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  42.69 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  43.48 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  41.43 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  44.09 
 
 
260 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 
324 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  45.6 
 
 
262 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  41.9 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  42.06 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.75 
 
 
262 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  41.9 
 
 
297 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  41.9 
 
 
297 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  46.69 
 
 
280 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  41.83 
 
 
269 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.9 
 
 
307 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  45.2 
 
 
262 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 
311 aa  205  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  47.26 
 
 
262 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  45.96 
 
 
267 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.7 
 
 
262 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
262 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.63 
 
 
257 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.82 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
295 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.24 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
261 aa  198  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.8 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
263 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.08 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  37.35 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  39.53 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  41.13 
 
 
272 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.8 
 
 
271 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  44.59 
 
 
262 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  48.13 
 
 
339 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
251 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  38.62 
 
 
255 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  46.91 
 
 
263 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.08 
 
 
259 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.51 
 
 
258 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  41.2 
 
 
409 aa  191  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  41.37 
 
 
268 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.67 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  41.67 
 
 
272 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  44.4 
 
 
268 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
265 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
266 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.34 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  46.59 
 
 
274 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  41.95 
 
 
259 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  49.55 
 
 
256 aa  187  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
278 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  41.8 
 
 
264 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
490 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.87 
 
 
255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.87 
 
 
255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
255 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
272 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  47.66 
 
 
257 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  43.53 
 
 
414 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 
255 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>