More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3390 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  98.85 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  64.82 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  61.98 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  61.34 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.92 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  59.09 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  58.68 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  59.44 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  62.39 
 
 		 264 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  61.6 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  61.28 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  59.51 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  49.57 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  52.97 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  52.12 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  47.41 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  53.97 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  52.97 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  53.31 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  53.6 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  53.47 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.8 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  43.63 
 
 		 490 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  44.86 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  43.62 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  38.34 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  47.73 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  45.88 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.81 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  43.44 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  47.01 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  41.57 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  40.17 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.76 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  40.52 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  46.67 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  40.43 
 
 		 409 aa  181  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  40.52 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  43.41 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  47.77 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  45.45 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  45.45 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  45.45 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.05 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.21 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  44.4 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  44.4 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  48.78 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.98 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  45 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  44.49 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  36.25 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  36.25 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.98 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.98 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.12 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.91 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  36.25 
 
 		 321 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  39.11 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  46.22 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  46.08 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.74 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  41.05 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  37.4 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  41.88 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  36.22 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>