More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1653 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  60.56 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  52.7 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  50.41 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  58.05 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  52.36 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  52.44 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  51.48 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 315 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  49.15 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  47.83 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  51.22 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  47.77 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  53.54 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  53.54 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  47.64 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  44.12 
 
 		 308 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.41 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51.05 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  47.44 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  47.44 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  47.44 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  48.03 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  47.62 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  45.28 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  47.22 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  42.68 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  43.62 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  41.6 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  42.68 
 
 		 297 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  42.68 
 
 		 297 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.7 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  42.68 
 
 		 297 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  41.84 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  42.02 
 
 		 321 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  41.6 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  47.04 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 295 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  41.6 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.58 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.9 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  42.55 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.84 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  45.92 
 
 		 280 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  43.22 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.84 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  50.41 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  44.07 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  40.98 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  41.81 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.1 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.37 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.37 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.24 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  39.66 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  41.49 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  38.62 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.4 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.65 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  37.97 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.8 
 
 		 339 aa  175  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.42 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  40.89 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  41.38 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  42.46 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  44.08 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  37.86 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  50 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.15 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1908  ABC transporter related  43.04 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.79 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  38.43 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  40.24 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.15 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>