More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1610 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  100 
 
 		 315 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  69.05 
 
 		 257 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  68 
 
 		 257 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  59.83 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  52.89 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  49.58 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  54.43 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  54.01 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  51.79 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 266 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  51.36 
 
 		 266 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  52.85 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  48.76 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  51.9 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  52.7 
 
 		 263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  50.67 
 
 		 262 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  51.2 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  47.74 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  42.01 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  42.01 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  45.26 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.49 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.8 
 
 		 285 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  51.01 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  40.65 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  40.65 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  51.67 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  40.65 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  52.87 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  49.61 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  41.6 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  42.64 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  40.29 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50.43 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.83 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  50.42 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40.61 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.64 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  48.61 
 
 		 267 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  45.31 
 
 		 264 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  55.23 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  42.8 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  41.95 
 
 		 270 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  53.97 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.5 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.55 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51.97 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  49.58 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  53.53 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  46.35 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.4 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.46 
 
 		 280 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  46.24 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  50.21 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 264 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 264 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  46.27 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.46 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  48.48 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 536 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  48.95 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  45.8 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.38 
 
 		 418 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>