More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0754 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  99.62 
 
 
264 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  79.77 
 
 
264 aa  407  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  73.49 
 
 
268 aa  359  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  62.6 
 
 
266 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  62.44 
 
 
263 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  62.1 
 
 
263 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  52.78 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  53.17 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  59.15 
 
 
260 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 
260 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  54.81 
 
 
262 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  48.43 
 
 
253 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.23 
 
 
262 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  59.91 
 
 
256 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  50.78 
 
 
253 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  54.36 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  51.78 
 
 
254 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  53.97 
 
 
262 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  51.9 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  52.8 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  48.76 
 
 
275 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51.24 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  50.98 
 
 
253 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  42.45 
 
 
409 aa  204  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  43.95 
 
 
255 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
255 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 
255 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  43.95 
 
 
255 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.49 
 
 
253 aa  202  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  43.55 
 
 
255 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  46.98 
 
 
285 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.8 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  44.09 
 
 
262 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  49.37 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  46.64 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 
311 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.98 
 
 
260 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  41.87 
 
 
326 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  45.73 
 
 
261 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
268 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  41.46 
 
 
321 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  41.46 
 
 
321 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
264 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.41 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.46 
 
 
269 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  43.5 
 
 
261 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
315 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  41.8 
 
 
261 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  43.5 
 
 
261 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  41.91 
 
 
279 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  43.5 
 
 
261 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  45.2 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.82 
 
 
259 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  38.89 
 
 
270 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
269 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  41.09 
 
 
293 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.32 
 
 
285 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
251 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.27 
 
 
254 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.6 
 
 
455 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
266 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  43.03 
 
 
259 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  44.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  46.8 
 
 
270 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  44.54 
 
 
262 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 
265 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  46.72 
 
 
273 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  39.22 
 
 
259 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  40 
 
 
297 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  40 
 
 
297 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  40 
 
 
297 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  39.84 
 
 
264 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  38.15 
 
 
259 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 
271 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
254 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.15 
 
 
257 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  42.74 
 
 
490 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  41.91 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  43.27 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 
418 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  45.95 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.83 
 
 
418 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.33 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  39.58 
 
 
293 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
260 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  42.86 
 
 
494 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  41.08 
 
 
258 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  39.58 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  42.24 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  39.92 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  42.24 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>