More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2584 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
266 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  59.5 
 
 
339 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  54.2 
 
 
254 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  48.1 
 
 
253 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 
261 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  54.85 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  50.82 
 
 
254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  50.39 
 
 
285 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  50.21 
 
 
254 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
251 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  52.61 
 
 
267 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  54.15 
 
 
257 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  47.14 
 
 
262 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  44.02 
 
 
253 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  50 
 
 
266 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  50 
 
 
262 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  46.67 
 
 
261 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
275 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3036  ABC transporter related  56.33 
 
 
260 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.66 
 
 
253 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3390  ABC Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  56.33 
 
 
260 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  47.52 
 
 
253 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
264 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  50.41 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  46.28 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  39.44 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 
264 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  44.02 
 
 
293 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.56 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  47.92 
 
 
255 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  42.19 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.34 
 
 
321 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  38.34 
 
 
321 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  50.45 
 
 
262 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  45.64 
 
 
280 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  39.17 
 
 
279 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
266 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.09 
 
 
262 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51.49 
 
 
251 aa  191  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  50.45 
 
 
262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.58 
 
 
285 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.56 
 
 
257 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.47 
 
 
266 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  50.45 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  38.75 
 
 
308 aa  188  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.88 
 
 
266 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  51.15 
 
 
263 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  38.84 
 
 
307 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
263 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  52.56 
 
 
274 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  39.17 
 
 
297 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  39.17 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  39.17 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.25 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  39.17 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  38.43 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.65 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  40.09 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  44.83 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  46.47 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  46.47 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  46.47 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  44.21 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
255 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.51 
 
 
259 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  36.25 
 
 
269 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 
324 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  41.67 
 
 
424 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  48.74 
 
 
259 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
295 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
265 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  41.7 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1653  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
265 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
263 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
249 aa  178  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 
268 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  50 
 
 
257 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  47.3 
 
 
263 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 
311 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
263 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  50.2 
 
 
257 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
265 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 
266 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
256 aa  175  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
536 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.95 
 
 
405 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.63 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  39.24 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  34.25 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>